1. 生物實驗室晶片
生物實驗室系統晶片(Lab-on-a-Chip)著重於將生物實驗室不同之操作流程整合在微型化的晶片上。利用這種技術，可減少試劑用量、縮短樣本的準備時間、快速篩選 減少成本。目前的技術包括微奈米機電系統、微奈米流體技術、電泳分離與介電泳操控、生物感測晶片、生物分子與細胞操控之系統晶片化、聚合脢鏈鎖反應及奈米生物技術等。
本課程即在提供對生物技術晶片化有興趣之大學部及研究所同學們基礎知識，強調以跨領域學習，以及常用的實驗量測方法，來增強同學們對此課程之了解與興趣。
2. 微奈米系統設計
本課程主要介紹有關微機電 (MEMS) 與奈米機電系統 (NEMS)的基本原理及應用技術，同時著重以整合系統分析之基本訓練。課程中將以實用的觀點探討目前實用的相關工業產品，包含壓力感測器 (pressure sensor, Motolora)、投影機 (micromirror, Texas Instrument)、加速器 (i-Phone, Analog Device) 、通訊開關 (RF switch)等課題。
3. 微處理機原理與應用
本課程主要介紹微處理機的軟硬體架構、操作原理、介面控制應用與系統整合。教學內容以8088/8086系列微處理機為核心，學習組合語言的指令架構與軟體設計方法，使修習者能熟悉記憶體、輸入輸出介面、DMA、中斷系統等之觀念與運作方法。課程中亦將對不同系列的微處理機如Z80、68000、8051等做基本架構之介紹。
另外，為了讓修課同學能有實際參與並且激發創意的空間，於學期末，同學組隊發表其學習成果。
期末專題成果發表: 2009 年、 2010 年、 2011 年、 2012 年
4. 工程圖學
工程圖學的教學內涵亦逐漸受到影響，本課程盼在有限的時間內，讓學生學習到完整的工程圖學知識，以及相關軟體的操作。
5. 最佳化設計
教授最佳化設計的基礎概念與理論，培養發展最佳化數值演算法的能力與實務應用。
6. 機械元件設計
7. 應用力學：動力學
8. 工程材料 (微奈米光電系統)
