網址：
http://evolution.berkeley.edu/evolibrary/home.php
分類：演化／教學
簡介：
這是一個非營利的教育網站，以生物演化的科學及教育為主，並且說明研究如何執行，也說明這領域內的構想如何隨時間變化。
從網站上方的site tour中，可以看到網站中主要的內容組成，也可發現許多具有特色的文章。其中的Evolution101，以深入淺出、多方向的方式帶領我們了解演化理論和機制，其內容包括對生物演化的定義和描述，介紹了系統發生及分類的方法，像同源、同功的差別，還有針對林奈系統分類的童趣記憶法，用King Philip Came Over For Good Soup來記憶Kingdom、Phylum、Class、Order、Fami ly、Genus、Species。其次在單一物種演化（microevolution）、物種形成（speciation）、宏觀演化（macroevolution）方面也有詳盡的介紹，從定義、發生原因到支持其理論的證據、對其他物種的影響等內容都有，配上可愛的卡通圖案或精美的照片，顯得非常活潑有趣。此外還有一些有趣的主題如對付網頁附圖：2007/1/5轉載有抗藥性的細菌、關於火蟻入侵、同源同功的詳盡介紹、比較與演化小測驗。再來可以看到此網站中的四個主要範疇，每個主題各包含了好幾個副標題和許多相關資源連結，主題像是演化的運作機制和細節的解釋，也有從農業、保存、藥物方面著手，說明演化如何影響我們的生活。另有演化的證據，例如在演化上的觀察所得到的結果，最後是演化學說的歷史，當然少不了Darwin、Wallace、Lamarck名演化學家！還有一處為老師所準備的教學資源，裡面有基礎演化資訊、課堂上的策略、適合各年齡層的觀念、課程方案等，提供了豐富的教學材料及指引，是很貼心的設計。每個月更新的Evo in the news，提供當前的議題及說明，可以從中獲得演化相關的最新資訊。
這網站能夠深入淺出的解釋演化的概念及許多相關應用，加上提供專業的研究報告，還有淺顯易懂的圖解說明，可以幫助所有的人學習演化。如果你想獲得任何跟演化有關的資訊，來這裡就對了！
相關網站：http://www.pbs.org/wgbh/evolution/change/deeptime/index.html Deep Time
網址：http://www.treebase.org
分類：演化／研究
簡介：
在閱讀研究報告時，我們常可看到作者針對某群基因或是某群生物進行譜系分析以了解其親緣關係，但生物的類群琳琅滿目，而研究成果又日新月異，往往使我們在整合資訊上，要耗費許多的心力，因此一個能幫助我們歸納統整樹網資料的網站便能帶給研究學者或大眾許多的方便，因此，TreeBASE的功能便日益彰顯。TreeBASE目前是由耶魯自然歷史博物館所主持的譜系關係資料庫，此網站收集了最新研究報告中的譜系樹（包括了基因樹、物種樹及族群樹等）以及其所根據的資料矩陣，並作歸類整合，因此只要在資料庫中鍵入關鍵字如物種名，便可得到記錄中與此物種相關的所有譜系分析結果，包括了樹型、資料矩陣檔案以及參考文獻等。研究者可以下載資料矩陣來進行更多的資料整合，進一步去探討物種的特徵演化、或是生物地理學等研究，而研究者們也可以將自己的譜系分析結果上傳到資料庫，以更新最新資料，是一個非常的實用且具有意義的網站。
相關網站：
http://www.evolutionsociety.org/ The Society for the Study of Evolution
http://ucjeps.berkeley.edu/bryolab/GPphylo/ Deep Green - Green Plant Phylogeny Research Coordination Group
網址：
http://evolve.zoo.ox.ac.uk/index.html
分類：演化／教學
簡介：
想知道如何利用分子序列進一步探討生物的演化議題嗎？那麼這個由英國牛津大學動物系所成立的網站，肯定能帶給你更多層面的認識。本站介紹由Paul Harvey教授所帶領的研究團隊在演化生物學，分子演化以及流行病學的譜系分析的最新計畫執行成果，包括了該團隊近期發表的期刊研究以及該團隊發表的研究中所利用的資料矩陣。此網站同時也提供了許多由該團隊研發的軟體工具，可以應用於譜系分析或是計算分子演化速率等，當然這些軟體的更新或修正也可在此下載。此外，網站裡也提供了全球研究分子演化或流行病菌演化的一些具代表性實驗室的網站連結，因此，很適合對分子演化有興趣的人前來一探究竟。
相關網站：
http://www.kuleuven.be/rega/cev/default.htm
http://tree.bio.ed.ac.uk/index.html
網址： http://phylogenomics.berkeley.edu/
分類：演化／教學
簡介：
在演化的過程中，只要基因發生一些微小的變異，便足以造成物種的分化或是新功能的產生。蛋白質或基因功能的系統基因組分析，就是一種功能基因體學的研究，藉著演化樹中分子譜系關係來進階分析分子序列變異，以增加分子功能預測的正確性，並可釐清在蛋白質結構改變時，其分子的功能變化。在這個網站裡，你可以比對分子序列來尋找相近的基因家族，或是利用已知的蛋白質結構去搜尋資料庫以獲得相關資訊。此外，這裡還有線上瀏覽生物工程學的課程，提供蛋白質體學的教學以及生物資訊應用在計算生物學及演化的方法介紹，而網站中更提供了一些實用的工具軟體，協助使用者進行分析或是結構預測，總之，如果你想獲得與蛋白質功能或結構相關的完整資訊，到這來一訪，一定滿載而歸。
相關網站：http://www.eurekascience.com/ICanDoThat/ I Can Do That!
網址：
http://tolweb.org/tree/phylogeny.html
分類：演化／教學
簡介：
不同生物間的關係，都可以用樹狀的連結串起其譜系，而世界上的生物若都能串連起來，便是我們地球的生命之樹。這個網站是由美國國家科學基金會以及亞歷桑納大學所贊助的線上資料庫平台，由上百位生物學專家和業餘的生物同好所合作編寫，收集了關於生物多樣性以及所有生物演化關係的資訊，希望將物種的鑑定特徵、圖片以及系統分類的資訊都數位化，以提供大眾更完整的資料。因此，若是你對於物種間的親緣關係有任何的疑惑，只要簡單的利用網站內的協助系統輸入物種名字，那麼，和該物種相關的譜系關係便會以簡圖呈現，並附上詳細的研究參考文獻，而該群物種的照片、生態介紹以及系群的演變史也會同時列出，讓人一目瞭然、收穫豐富。在這個網站裡，除了有生物學家提供專業的生物資訊外，還有很多有趣的生物故事、遊戲以及活動設計等教學教案分享，因此將精彩的生物知識豐富呈現，也更貼近的大眾的生活。此外，此網站也歡迎學生、教師或是業餘的生物同好的加入，分享生物的照片或是研究計畫報告，一同成為樹屋（tree house）的建造成員喔∼
相關網站：
http://www.actionbioscience.org/evolution/index.html Issues in Evolution.
http://www.scienceimage.csiro.au/ Scienceimage
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