College of Life Science

 
 

 NGS

高通量定序平台

High-throughput Sequencing


儀器簡介

計費方式

申請方法

送樣須知 資料分析
Introduction

Charge

How to apply

Deliver sample Data analysis

儀器簡介

TechComm 次世代定序核心實驗室 (NGS Core) 由生命科學院及系統生物學研究中心共同支援,提供校內外各單位 NGS 相關諮詢及定序服務。本核心實驗室採用 Illumina MiSeq 定序平台,可服務專案類型、建議定序長度如下:

NGS service

*UMI 為 Unique Molecular Index,採用 Qiagen QIAseq miRNA Library Kit 建庫

大量定序可轉介 TechComm 合作廠商,提供優惠定序價格。

NGS 建庫其他相關耗材及服務請見最新價目表

專案諮詢請電洽技術員 33669680 蕭君儀技術員 chunyihsiao@ntu.edu.tw、江蘇峰博士 sufeng.chiang@gmail.com

 


專案計費方式

定序服務計價包括三部分,使用者可自行試算:

        專案總價 = 樣本建庫費用 + 上機試劑費用 + 上機服務費

(1) 其中樣本建庫費用 (包括樣本建庫及 Library QC,可申請免費教學)

建庫費用

*項次 1-3 大量建庫 (樣本數>6) 優惠,請洽技術員報價。

**收件樣本為一次PCR產物 (一次PCR引子需接上Illumina sequencing linker,引子設計可洽技術員)。本建庫費用包含 per library Qubit 定量、library pooling、pooled library BioAnalyzer size QC 及 qPCR 定量 QC (單次專案樣本數<16,將另收 Library QC 相關費用)。

 

(2) Illumina MiSeq 定序試劑規格、定價及上機服務費:

試劑費用

*以上所列為標準模式定序輸出量,Qiagen microRNA、PCR Amplicons 及 16S/ITS metagenomics library 依實際輸出量為準。

**TechComm NGS 專案使用者享定序試劑優惠價,請來電詢問。

***2021/12/31 前簽定付費 NGS 專案合約使用者享上機服務費五折優惠。

 


申請方法

NGS 定序服務採專案簽約,服務流程如下:

服務流程

如有相關疑問,歡迎與 NGS 工作團隊 聯繫

 


送樣須知

NGS Core 接受 DNA/RNA 樣本,RNA 樣本請使用 Agilent BioAnalyzer 進行樣本品質確認。TechComm Agilent BioAnalyzer 預約及使用,請洽儀器負責人高毓鄖小姐。

樣本收件品質標準:DNA/RNA 送件樣本請溶於純水 (Nuclease free water) 或 Low TE buffer

送件須知

 

 

 

 

 

 

 

 

*OD260/230 常因萃取核酸所使用試劑不同而未能達到標準,若未達標準請與技術員討論。

 


NGS library 代建構委託與實驗教學服務計費方式

本單位提供委託代做樣本建庫與實驗教學服務,使用者請自備相關藥品及耗材 (包括 Library kit、PCR tubes 及 tips 等),本單位提供免費使用 PCR machine 及部分實驗所需儀器 (如分光光度計、離心機及震盪機等)。其他相關儀器及耗材可視實驗需求付費使用 (如 Qubit 定量儀、Covaris、BioAnalyzer、小型直立式電泳與電泳膠及 AMPure XP beads 等)。

送件須知

 

 

 

 

*DNA library (不進行切膠選擇特定範圍片段) 建構以二日為計費單位,RNA library (不進行切膠選擇特定範圍片段) 建構以 三日 為計費單位,若需要切膠則多加一日,其他類型 libraries請洽技術人員。單次委託代建庫以 8 個樣本為計費單位,若因故需進行 Troubleshooting,則亦需加收工本費,並以日計算。 樣本建庫教學限定非專案使用者 (專案使用者於專案進行間可派員接受一次免費教學訓練),技術人員將全程指導使用者實驗操作 (包括 protocol 討論解說與相關使用儀器之教學)。

 


NGS 資料分析

CLC Genomics Workbench with Microbial Genomic Module

使用費及教學諮詢費用計費標準 (2021/02/17 起)

收費種類

收費模式

校內定價

校外定價

使用費 每時段收費
 9:00 ~ 13:00; 13:00 ~ 17:00; 17:00 ~ 21:00;
21:00 ~ 1:00; 1:00 ~ 5:00; 5:00 ~ 9:00
全天共 6 時段
NTD 200/時段 NTD 400/時段
教學諮詢費 每小時收費服務時間 9:00 ~ 17:00 NTD 400/小時 NTD 800/小時

 

使用注意事項:

(1) 使用請先電洽 3366-9680 江蘇峰 博士諮詢、預約,限於上班時段前來上機設定。

(2) 因不可預期之硬體問題導致使用者正在進行的分析程序中斷,受到硬體故障影響之使用費不予收費。

(3) NGS 專案使用者,於簽訂專案合約半年內,享有一個月 CLC 使用與教學免費之優惠服務,並以該次委託建庫或定序所產生之資料分析為限。單純建庫並委外定序之專案,若因不可抗力因素,簽訂合約半年後仍未收到委外廠商回傳定序資料,CLC 優惠期另議。

(4) NGS 專案使用者申請系統生物學中心生物資訊核心實驗室分析服務,享有優惠

(5) NGS 專案委託建庫並委託使用 TechComm MiSeq 定序儀進行定序,系統生物學中心各項 NGS 分析服務以定價半價優惠,以該次委託建庫定序所產生之資料分析為限。若為較特殊的 NGS 分析,如 de novo transcriptome,可申請 Project-based 分析專案服務。

 

次世代定序資料亦可申請系統生物學中心生物資訊核心實驗室分析服務,服務項目及費用請見連結說明。


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2021/02/22