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本所於民國三十六年八月成立，初期包括生理，生化及藥理三組，後來生化和藥理兩組分別成立了研究所。依現行的組織體系，台大醫學院生理學研究所和生理學科是科所合一的研究教學單位。目前本所每年招收十 四名碩士班及五名博士班研究生。 日據時代的醫專和台北帝大醫學部生理學教室即為本所的前身。光復後改為國立台灣大學醫學院生理學科，當時國人在本單位服務的有邱德金博士，張鎮教授，彭明聰教授(由藥理科轉來)及黃廷飛教授(由生化科轉來)。方懷時教授於民國三十六年七月到本校任教，後三位一直在本所執教，目前皆已退休，但仍繼續貢獻所學。其中方懷時教授時及彭明聰教授曾於民國六十七年當選為中央研究院院士，更是本所的榮耀。本所歷屆所長依序為方懷石教授、彭明聰教授、黃廷飛教授、傅祖慶教授、陳朝峰教授、蔡元奮教授及賴義隆教授，目前所長為郭鐘金教授擔任。本所所務在他們的領導下蒸蒸日上。 本所目前研究的方向大致分為內分泌學、神經生理學、心臟血管生理學、環境及腎臟生理學、行為生理學、消化道生理學及細胞生理學等七組。所長由郭鐘金教授擔任，所內專任教師目前共有9位，兼任教師共有7位，其中教授12位，副教授1位，助理教授4位，皆曾在國內外著名學府研習生理學。各位老師的研究方向、學術著作、實驗室成員請參照師資及研究方向。 展望未來，本學科將努力延攬德術兼備的俊彥學者，增強師資陣容，改善教學方法，擴充研究實驗器材設備，提昇本學科教學和研究的水準，為國家培育更多優秀的生理學人才，奠定醫學教育更堅實的基礎。
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(一)碩士班甄試招生：
(A)報考資格：名次規定（在校學業總名次列全班(組)人數前50%）
(B)報名應繳交之資料：
1.報名表
2.名次證明書或服務年資證明書一份
3.學位證書或學生證
4.歷年成績單一份
5.回件信封三個
6.教授推薦函一至二封
7.自傳一份
(C)審查佔總成績比例：50%
(D)口試佔總成績比例：50%
(E)錄取名額：六名
(二)碩士班招生：
（Ａ）筆試
I.共同科目：英文(A)。
II.專門科目：
1.必考科目: 生理學
2.選考科目:（四科擇一）
(1)生物化學( 一般生物化學)
(2)藥理學
(3)普通生物學(A)
(4)生命科學
（Ｂ）口試
（Ｃ）報考資格：
公立或已立案之私立大學或獨立學院或經教育部認可之國外大學畢業得有學士學位者。
（Ｄ）錄取名額：七名
＊備註：
1. 口試成績佔專科總成績 ３０％，口試時間，地點另行通知。
2. 口試時應攜帶自傳及大學歷年成績單。
3. 選考科目應在報名表科目欄內註明。
4. 英文(A)成績不計入考試總分計算，惟成績未達40分者，不予錄取。
5. 口試原始分數未達七十分者不予錄取。
6. 生理學加權50%。
(二)博士班招生： 招生名額：5名
報考資格：
獲有碩士學位者。
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審查 |
佔總成績比例：40% 就所繳資料加以審查。 |
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筆試 |
佔總成績比例：40%
生理學 |
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口試 |
佔總成績比例：20% 地點：北市仁愛路一段1號台大醫學院基礎醫學大樓10樓生理討論室(1003室) |