B-class gene accession information


Compiled by Jer-Ming Hu, March 2006

NOTE: B-class homologues in bryophytes and ferns are very diverse and can not be categorized in AP3 or PI lineages.

 

Species

APETALA3

PISTILLATA

 

 

paleoAP3

euAP3

TM6

 

BRYOPHYTES

 

 

 

 

 

Funariales

 

 

 

 

 

  Funariaceae

Physcomitrella patens

PPM2 (AF150933, p=AAG09137)

 

 

 

FERNS

 

 

 

 

 

Filicales

 

 

 

 

 

  Pteridaceae

Ceratopteris richardii

CMADS3 (CRU95608, p=AAC24319) (=CRM1=CERMADS4)

 

 

 

GYMNOSPERMS

 

 

 

 

 

Gnetales

 

 

 

 

 

  Gnetaceae

Gnetum gnemon

GGM2 (AJ132208, p=CAB44448),

GGM13 (AJ132219, p=CAB44459),

GGM3 (AJ132209, p=CAB44449)

 

 

 

Coniferales

 

 

 

 

 

  Pinaceae

Picea abies

DAL12-1 (AF158541, p=AAF18374)

 

 

DAL11 (AF158539, p=AAF18372),

DAL13 (AF158543, p=AAF18376)

Pinus radiata

 

 

 

PrDGL (AF120097, p=AAF28863)

ANGIOSPERMS

 

 

 

 

 

Basal angiosperms

 

 

 

 

 

Amborellaceae

Amborella trichopoda 

AmtAP3-1 (AY337743)

AmtAP3-2 (AY337744)

 

 

AmtPI (AY337760)

Chloranthaceae

Chloranthus spicatus

CsAP3 (AF230701, p=AAF73930)

 

 

 CsPI (AF230710, p=AAF73939)

Illiciaceae Illicium parviflorum IlpAP3 (AY337747)

IlpAP3.1 (AY936225)

IlpAP3.2 (AY936226)

IlpAP3.3 (AY936227)

 

 

IlpPI (AY936224)

Laurales

 

 

 

 

 

  Calycanthaceae

Calycanthus floridus

CfAP3-1 (AF230699, p=AAF73928),

CfAP3-2 (AF230700, p=AAF73929)

 

 

CfPI-1 (AF230708, p=AAF73937),

CfPI-2 (AF230709, p=AAF73938)

Lauraceae

Persea americana

PeaAP3 (AY337748) 

 

 

PeaPI (AY337738, p=AAR06672.1)

Magnoliales

 

 

 

 

 

  Annonaceae

Asimina longifolia AslAP3 (AY337749)

AslPI (AY337739)

  Eupomatiaceae

Eupomatia bennettii EubAP3-1 (AY337750)

EubAP3-2 (AY337751)

 

 

EubPI (AY337740)

Eupomatia laurina

 

 

EulPI (AY337741)

  Magnoliaceae

Liriodendron tulipifera

LtAP3 (AF052878, p=AAC42593)

 

 

LtPI (AF052864, p=AAC42579)

Magnolia grandiflora MagAP3 (AY337752)

 

 

Magnolia praecocissima MpMADS7 (AB050649)

 

 

MpMADS8 (AB050650)

 

Michelia figo

MfAP3 (AF052877, p=AAC42592)

 

 

MfPI (AF052863, p=AAC42578)

Nymphaeales

 

 

 

 

 

Nymphaeaceae

Nuphar advena

 

 

 NuaPI (AY337736)

Nuphar variegatum

 

 

 NuvPI (AY337737)

Piperales

 

 

 

 

 

  Aristolochiaceae

Asarum europaeum

AeAP3-1 (AF230697, p=AAF73926),

AeAP3-2 (AF230698, p=AAF73927)

 

 

AePI (AF230707, p=AAF73936)

  Piperaceae

Peperomia hirta

PhAP3 (AF052879, p=AAC42594)

 

 

PhPI (AF052865, p=AAC42580)

 

Piper magnificum

 

 

 

PmPI-1 (AF052866, p=AAC42581.1),

PmPI-2 (AF052867, p=AAC42582)

  Saururaceae

Saururus chinensis MADS651 (AY057378)

 

 

Monocots

 

 

 

 

 

Alismatales

 

 

 

 

 

  Alismataceae

Sagittaria montevidensis

SmAP3 (AF230705, p=AAF73934)

 

 

SmPI (AF230712, p=AAF73941)

Asparagales

 

 

 

 

 

  Hemerocalidaceae

Hemerocallis hybrid cv.

HhMADS1 (AF209729, p=AAG35773)

 

 

 

  Hyacinthaceae

Hyacinthus orientalis

 

 

 

HPI1 (AF134114, p=AAD22493),

HPI2 (AF134115, p=AAD22494)

Dioscoreales

 

 

 

 

 

  Taccaceae

Tacca chantieri

TcAP3 (AF73935)

 

 

TcPI (AF73942)

Poales

 

 

 

 

 

  Poaceae

Oryza sativa

OsMADS16 (AF077760, p=AAD19872)

 

 

OsMADS2 (L37526, p=AAB52709), OsMADS4 (L37527)

 

Triticum aestivum

TaMADS#51 (AB007506, p=BAA33459)

 

 

 

 

Zea mays

SILKY-1 (AF181479, p=AAF59838)

 

 

 

Eudicots

 

 

 

 

 

Ranunculales

 

 

 

 

 

  Fumariaceae

Dicentra eximia

DeAP3-1 (AF052875)

 

 

DePI (AF052857, p=AAC42572)

  Papaveraceae

Papaver californicus

PcAP3 (AF052872, p=AAC42587)

 

 

 

 

Papaver nudicaule

PnAP3-1 (AF052873, p=AAC42588),

PnAP3-2 (AF052874, p=AAC42589)

 

 

PnPI-2 (AF052856, p=AAC42571)

 

Sanguinaria canadensis

ScAP3 (AF130868, p=AAD31696)

 

 

ScPI (AF130871, p=AAD31699)

  Ranunculaceae

Delphinium ajacis

 

 

 

DaPI (AF052862, p=AAC42577)

 

Eranthis hyemalis

EhAP3 (AY053362, p=AAL15150)

 

 

 

 

Ranunculus bulbosus

RbAP3-1 (AF052876, p=AAC42591),

RbAP3-2 (AF130869, p=AAD31697)

 

 

RbPI-1 (AF052859, p=AAC42574),

RbPI-2 (AF052860, p=AAC42575)

 

Ranunculus ficaria

RfAP3-1 (AF052854, p=AAC42569),

RfAP3-2 (AF130870, p=AAD31698)

 

 

RfPI-1 (AF052858, p=AAC42573),

RfPI-2 (AF130872, p=AAD31700)

Proteales

 

 

 

 

 

  Buxaceae

Pachysandra terminalis

PtAP3-1 (AF052870, p=AAC42585)

 

 

PtAP3-2 (AF052871, p=AAC42586)

Caryophyllalles

 

 

 

 

 

  Caryophyllaceae

Dianthus caryophyllus

 

 

CMB2 (L40405, p=AAB05559)

 

 

Silene latifolia

 

SLM3 (X80490, p=CAA56657)

 

SLM2 (X80489)

  Polygonaceae

Rumex acetosa

 

RAD1 (U28482, p=AAA80304),

RAD2 (U28484, p=AAA80306)

 

 

Malpighales

 

 

 

 

 

  Salicaceae

Populus tremuloides

 

 

PTD (AF057708)

 

Cornales

 

 

 

 

 

  Cornaceae

Cornus alba

 

 

CoralbTM6

CoralbPI1,

CoralbPIJ394

 

Cornus florida

 

CorfloAP3c1,

CorfloAP3c2

 

CorfloPI

  Hydrangeaceae

Hydrangea macrophylla

 

HmAP3 (AF230702, p=AAF73931)

HmTM6 (AF230703, p=AAF73932)

HmPI (AF230711, p=AAF73940)

Cucurbitales

 

 

 

 

 

  Cucurbitaceae

Cucumis sativus

 

 

 

CUM26 (AF043255, AAD02250)

Fabales

 

 

 

 

 

  Fabaceae

Medicgo sativa

 

NMH7 (L41727, p=AAB48660)

 

NGL9 (AF335473, p=AAK77938)

Fagales

 

 

 

 

 

  Juglandaceae

Juglans regia

 

JrAP3 (AJ313089,  p=CAC38765)

 

 

Rosales

 

 

 

 

 

  Rosaceae

Malus x domestica

 

 

 

MdPI (AJ291490, p=CAC28021)

 

Rosa rugosa

 

 

MASAKO B3 (AB055966, p=BAB63261)

MASAKOBP (AB038462, p=BAB11939)

Myrtales

 

 

 

 

 

  Myrtaceae

Eucalyptus grandis

 

 

 

EGM2 (AF029976, p=AAC78283)

Brassicales

 

 

 

 

 

  Brassicaceae

Arabidopsis lyrata

 

AlAP3 (AF143380, p=AAF25590)

 

AlPI (AF143382, p=AAF25591)

 

Arabidopsis thaliana

 

AP3 (D21125)

 

PI (D30807)

 

Brassica napus

 

BnAP3 (AF124814, p=AAF28894)

 

 

Solanales

 

 

 

 

 

  Solanaceae

Lycopersion esculentum

 

LeAP3 (AF052868)

TM6 (=TDR6, X60759)

 

 

Nicotiana tabacum

 

NTDEF (X96428, p=CAA65288)

 

NTGLO (X67959)

 

Petunia hybrida

 

PMADS1 (X69946, p=CAA49567)

PhTM6 (AF230704)

FBP1 (M91190),  PMADS2 (X69947, p=CAA49586)

 

Solanum tuberosum

 

STDEF (=DEF4, X67511, p=CAA47846)

PD2 (?)

 

Lamiales

 

 

 

 

 

  Oleaceae

Syringa vulgaris

 

SvAP3 (AF052869)

 

SvPI-1 (AF052861, p=AAC42576)

  Scrophulariaceae

Antirrhinum majus

 

DEF (X62810)

 

GLO (x68831)

 

Mimulus guttatus

 

MgAP3 (AF381766, p=AAK68069)

 

 

 

Mimulus nasutus

 

MnAP3 (AF381767, p=AAK68070)

 

 

Asterales

 

 

 

 

 

  Asteraceae

Gerbera hybrida

 

GDEF2 (AJ009725, p=CAA08803)

GDEF1 (AJ009724, p=CAA08802)

GGLO1 (AJ009726, p=CAA08804)

 

Hieracium piloselloides

 

HPDEF1 (AF180364, p=AAD53325)

HPDEF2 (AF180365, p=AAD53326)