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一、歷年學術著作：（依發表年月排序）

A.期刊論文

1. 黃啟書，《禮記‧樂記》論「和」諸義蠡探，中國文學研究，11期，頁143-156，1997年5月。

2. 黃啟書，陸增祥《八瓊室金石補正》之纂輯與其對金石學的貢獻，文史哲學報，51期，頁111-164，1999年12月。

3. 黃啟書，管子兵學思想蠡探：以〈白心〉篇「兵之出，出於人」為例，成大中文學報，10期，頁183-212，2002年10月。

4. 黃啟書，由元末政局看《郁離子》中的賢人政治，中國文學研究，17期，頁1-54，2003年6月。

5. 黃啟書，試論劉向災異學說之轉變，臺大中文學報，26期，頁119至151，2007年6月。

6. 黃啟書，試論劉向、劉歆《洪範五行傳論》之異同，臺大中文學報，27期，頁123至166，2007年12月。

B.會議論文

1. 黃啟書，何休《春秋公羊解詁》災異例的考察，第一屆研究生「春秋經學學術研討會」，臺北：臺灣大學哲學系，2001年10月。

C.專書及專書論文

1. 黃啟書，董仲舒春秋學中的災異理論，臺大中文所碩士論文，224頁，1995年5月。

2. 黃啟書，春秋公羊災異學說流變研究：以何休《春秋公羊解詁》為中心之考察，臺大中文所博士論文，497頁，2003年6月。

3. 黃啟書，王充《論衡》中所見災異說及其批判，第二屆儒道國際學術研討會(兩漢)論文集，臺北：臺灣師範大學國文學系，頁597至643，2005年8月。

4. 黃啟書，試探漢代災變之禮—以日食為例，孔德成先生學術與薪傳研討會論文集，臺北：臺灣大學文學院，頁395至432，2009年12月。

D.技術報告

1.黃啟書，出土日書資料與現存元明清通書內容比較研究，國科會研究計畫成果報告，NSC 91-2411-H-002-056，2002年8月1日~2003年7月31日。

2. 黃啟書，第二梯次提昇大學基礎教育計畫分項計畫一：「臺灣大學寫作教學中心之建置」，教育部計畫，乙-91-FA01-4，2002年9月1日～2006年8月31日。

3. 黃啟書，洪範五行傳災異學說研究—以劉向、劉歆《洪範五行傳論》為中心，國科會研究計畫成果報告，NSC 94-2411-H-002-071，2005年8月1日～2006年7月31日。

4. 黃啟書，應劭災異觀念試探—以《風俗通義》為中心，國科會研究計畫成果報告，NSC 97-2410-H-002-137，2008年8月1日～2009年7月31日。

二、學術交流：

1. 第三屆「孔孟故里尋根」，濟南：山東大學，2002年7月。

2. 第二屆「漢文化資料庫國際學術研討會」，澳門：澳門大學，2002年9月。

三、教學網站