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一、歷年學術著作：（依發表年月排序）

A.期刊論文

陳昭瑛，藝術與革命：馬庫色[Herbert Marcuse]美學初步研究 (上)，中外文學， 13卷10期，頁132-148，1985年3月。
陳昭瑛，藝術與革命：馬庫色[Herbert Marcuse]美學初步研究 (下)，中外文學， 13卷11期，頁132-167，1985年4月。
陳昭瑛，一個時代的開始――激進的儒家徐復觀先生，歷史月刊，15期，頁20- 25，1989年4月。
陳昭瑛，霸權與典律：葛蘭西的文化理論，中外文學，21卷2期，頁54-92 ，1992年7月。（專輯：中西文學典律的形成與文學教學專號）
陳昭瑛，黑格爾「歷史哲學」中的「整體性」概念，鵝湖學誌，9期，頁97-130，1992年12月。
陳昭瑛，明鄭時期的臺灣文學的民族性，中外文學，22卷4期，頁18-47，1993年9月。（專輯：國家文學專輯）
1995年2月，論臺灣的本土化運動：一個文化史的考察，中外文學，23卷9期，頁6- 43（專輯：「臺灣文學的動向」專輯）。
陳昭瑛，追尋「臺灣人」的定義：敬答廖朝陽、張國慶兩位先生，中外文學，23 卷11期，頁136-140，1995年4月。
陳昭瑛，發現臺灣真正的殖民史：敬答陳芳明先生，中外文學，24卷4期，頁77- 93，1996年9月。
陳昭瑛，臺灣古典詩歌選本的意識形態：敬答許俊雅、施懿琳兩教授，中外文學，25卷9期，頁180-186，1997年6月。
陳昭瑛，臺灣的文昌帝君信仰與儒家道統意織，文史哲學報，46期，頁173-197，1997年6月。
陳昭瑛，1998年3月，一根金花：論賴和的〈一桿「稱仔」〉，中國現代文學理論，9期，頁23- 36。
陳昭瑛，明鄭時期臺灣的中國傳統文化，哲學雜誌，25期，頁50-67 ，1998年8月。（專輯：哲學．臺灣）
陳昭瑛，連橫《臺灣通史》與儒家的春秋史學，中國哲學，22輯，2000年。
陳昭瑛，「通」與「儒」：荀子的通變觀與經典詮釋問題，臺大歷史學報，28期，頁207-223，2001年12月。

B.會議論文

陳昭瑛，朱熹的《詩集傳》與儒家的文學社會學，國際朱子學會議，中央研究院中國文哲研究所主辦，1992年5月。
陳昭瑛，馬克思主義和儒家的文學觀：內在目的論的觀點，文學學研討會，佛光大學主辦，1995年4月。
陳昭瑛，當代儒學與臺灣本土化運動，中央研究院中國文哲研究所主辦，第三次當代儒學研討會，1995年4月。
1996年6月，文學的原住民與原住民的文學──從「異己」到「主體」，百年來中國文學國際學術研討會，中央日報、臺大文學院主辦。
陳昭瑛，日據時期傳統詩社櫟社的歷史轉折：從傳統遺民文學到近代民族運動，臺大中文系學術演講講稿，1996年12月。
陳昭瑛，儒學在臺灣的移植與發展：從明鄭至日據時代，東亞近現代儒學的回顧國際研討會，中研院中國文哲所主辦，1996年12月。
陳昭瑛，清代臺灣鳳山縣的儒學教育，第五屆高雄文化發展史研討會，高雄市教育局主辦，1996年12月。
陳昭瑛，光復初期「臺灣文化」的概念，二二八事件五十周年學術研討會，夏潮基金會、臺灣史研究會主辦，1997年2月。
陳昭瑛，1997年4月，臺灣的文昌帝君信仰與儒家的道統意識，臺灣儒學國際研討會，成功大學中文系主辦。
陳昭瑛，日據時期臺灣儒學的殖民地經驗，儒學與世界文明國際研討會，新加坡國立大學主辦，1997年6月。
陳昭瑛，《臺灣通史‧吳鳳列傳》中的儒家思想，「中國近代文化的解構與重建‧連橫」研討會，政治大學文學院主辦，1997年。
陳昭瑛，啟蒙、解放與傳統：論20年代臺灣知識份子的文化省思，《跨世紀臺灣的文化發展》臺大七十週年校慶國際會議，臺灣大學主辦，1998年10月。
陳昭瑛，發現一個典型：王敏川，哈佛儒學研討會，1998年10月。
陳昭瑛，清代臺灣教育碑文中的朱子學，《儒家思想在現代東亞》國際會議，中央研究院中國文哲研究所主辦，1999年7月。
陳昭瑛，性情中人：試從楚文化論《郭店楚簡‧性情篇》，《郭店楚墓竹簡》國際會議，武漢大學與哈佛燕京學社主辦，1999年10月。
陳昭瑛，吳濁流《亞細亞的孤兒》中的儒學思想，第二屆臺灣儒學國際會議，成功大學中文系主辦，1999年12月。
陳昭瑛，儒家詩學與日據時代的臺灣：經典詮釋的脈絡，《中國文化的經典詮釋傳統》計劃第八次研討會，臺灣大學「中國文化的經典詮釋傳統」計劃主辦，2000年3月。
陳昭瑛，道東之傳：清代臺灣書院學規中的朱子學，《朱子學與東亞文明》國際會議，臺北：漢學研究中心主辦，2000年11月。
陳昭瑛，孔子詩樂美學中的「整體性」概念，第二屆《中華文明的二十一世紀新意義》國際會議，喜瑪拉雅基金會、中國哲學與文化研究基金會、史丹福大學亞洲語言學系主辦，2001年4月。
陳昭瑛，孟子「知人論世」說與經典詮釋問題，《東亞儒學中的經典詮釋傳統》計劃第七次研討會，臺灣大學「東亞近世儒學中的經典詮釋傳統」研究計劃主辦，2001年6月。
陳昭瑛， “Text and Context: Mencius’ View on the Understanding of Poems of the Ancients”, “Interpretation and Intellectual Change in China: An International Conference on the History of Chinese Hermeneutics” 國際會議，美國Rutgers大學主辦，2001年10月。
陳昭瑛，先秦儒家與經典詮釋問題，《文本與實在——人文學中的詮釋問題》學術會議，香港科技大學人文學部主辦，2001年11月。
陳昭瑛，連橫的《台灣通史》與清代公羊思想，台灣大學總圖書館，《文化場域與教育視界》國際會議，台灣大學與美國哥倫比亞大學主辦，2002年11月。
陳昭瑛，連橫《台灣通史》中的「民族」概念：舊學與新義，台灣大學中文系學術演講論文，2003年10月。

C.專書及專書論文

陳昭瑛，藝術的辯證：黑格爾與盧卡契，臺大哲學所碩士論文，1986年。
陳昭瑛，班雅明和馬克思主義的文學理論，文學的後設思考：當代文學理論家，正中書局，1991年。
陳昭瑛，劉勰的文類理論與儒家的整體性世界觀：一個辯護，臺大外文所博士論文中文本，1993年。
陳昭瑛，The Marxist-Confucian Concepts of Totality : Liu Hsieh's Theory of Genres，臺大外文所博士論文，1993年。
陳昭瑛，西方馬克思主義美學，美學研習營論文集，師大人文教育中心，1994年。
陳昭瑛，分流教育的改革:理論,實務與對策，與黃俊傑、吳展良合著，行政院教育改革審議委員會行政院教育改革審議委員會委託研究案學術研討會系列3－－"分流教育"學術研討會，1996年。
陳昭瑛，臺灣文學與本土化運動，正中書局，1998年。
陳昭瑛，臺灣與傳統文化，中山學術基金會出版，1999年。
陳昭瑛，臺灣儒學：起源、發展與轉化，324頁，臺北：正中書局，2000年。
陳昭瑛，誰召同胞未死魂：葉榮鐘《早年文集》的志業與思想，《葉榮鐘全集‧早年文集》，「導論」。臺中：晨星出版社，2002年。

D.技術報告

陳昭瑛，明清時期臺灣的教育及其對現代通識教育的啟示，行政院國家科學委員會（行政院國家科學委員會專題研究計畫－－傳統中國教育與現代通識教育之研究，執行期間：83年8月1日至84 年7月31日）。
陳昭瑛，臺灣通史課程的通識內涵與教學設計，行政院國科會專題研究計畫──以傳統中國文化為本的通識教育內涵之研究，執行期間：85年8月1日至86年7月31日，本計畫係"以傳統中國文化為本的通識教育內涵之研究"之子計畫十二）。
陳昭瑛，儒家的春秋史學與連橫的《臺灣通史》，大學學術追求卓越發展計劃──東亞近世儒學中的經典詮釋傳統之研究，執行期間：2000年1月至2003年12月。

二、其他著作：

A. 教科書

陳昭瑛，臺灣詩選注，正中書局，1996年。

B. 創作和譯作

陳昭瑛，江山有待（小說），采風出版社，1980年。
陳昭瑛，美學的面向：藝術與革命 / 馬庫色(Herbert Marcuse)作，陳昭瑛譯註，南方出版社，1987年（附錄：藝術與革命等3種，譯自：The Aesthetic Dimension）。

三、學術獎勵及榮譽：

第二屆五四文藝評論獎。